Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TnrQ8BYI9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TnrQ8BYI9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms