Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY2

C130079G13Rik, RIKEN cDNA C130079G13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C130079G13RikQ8BUY2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C130079G13RikQ8BUY2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C130079G13RikQ8BUY2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms