Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSZ2

Ap3s2, AP-3 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s2Q8BSZ2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ap3s2Q8BSZ2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms