Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc2Q8BKV1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc2Q8BKV1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc2Q8BKV1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc2Q8BKV1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc2Q8BKV1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc2Q8BKV1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc2Q8BKV1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc2Q8BKV1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc2Q8BKV1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc2Q8BKV1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc2Q8BKV1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc2Q8BKV1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc2Q8BKV1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc2Q8BKV1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc2Q8BKV1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc2Q8BKV1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc2Q8BKV1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc2Q8BKV1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpc2Q8BKV1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpc2Q8BKV1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpc2Q8BKV1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpc2Q8BKV1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpc2Q8BKV1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpc2Q8BKV1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpc2Q8BKV1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms