Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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