Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms