Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rph3alQ768S4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3alQ768S4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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