Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms