Protein–RNA interactions for Protein: Q64697

Ptprcap, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcapQ64697 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprcapQ64697 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprcapQ64697 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprcapQ64697 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprcapQ64697 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprcapQ64697 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprcapQ64697 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprcapQ64697 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprcapQ64697 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprcapQ64697 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprcapQ64697 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprcapQ64697 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprcapQ64697 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprcapQ64697 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprcapQ64697 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprcapQ64697 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprcapQ64697 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprcapQ64697 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprcapQ64697 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprcapQ64697 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms