Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrkQ60976 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
JrkQ60976 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrkQ60976 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrkQ60976 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrkQ60976 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
JrkQ60976 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JrkQ60976 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrkQ60976 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrkQ60976 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JrkQ60976 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms