Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rtp3Q5QGU6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.3 ms