Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc3Q5DU56 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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