Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms