Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430531B16RikQ3V2J1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms