Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms