Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms