Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm648Q3UJ22 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm648Q3UJ22 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Gm648Q3UJ22 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Gm648Q3UJ22 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Gm648Q3UJ22 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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