Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pid1Q3UBG2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms