Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms