Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd11Q1RNF8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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