Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Rpusd2Q149F1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Rpusd2Q149F1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Rpusd2Q149F1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Rpusd2Q149F1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Rpusd2Q149F1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Rpusd2Q149F1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Rpusd2Q149F1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Rpusd2Q149F1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Rpusd2Q149F1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Rpusd2Q149F1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Rpusd2Q149F1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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