Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spatc1Q148B6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms