Protein–RNA interactions for Protein: Q12675

DNF2, Phospholipid-transporting ATPase DNF2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,612 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DNF2Q12675 snR40snR40 97 nt-6.85□□□□□ -3.51
DNF2Q12675 Q0017Q0017 162 nt-6.88□□□□□ -3.51
DNF2Q12675 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-6.89□□□□□ -3.51
DNF2Q12675 YLR294CYLR294C 330 nt-6.94□□□□□ -3.52
DNF2Q12675 snR64snR64 101 nt-6.98□□□□□ -3.53
DNF2Q12675 Q0143Q0143 153 nt-7.17□□□□□ -3.56
DNF2Q12675 snR62snR62 100 nt-7.24□□□□□ -3.57
DNF2Q12675 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-7.29□□□□□ -3.58
DNF2Q12675 VAR1Q0140 1197 nt-7.46□□□□□ -3.6
DNF2Q12675 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-7.49□□□□□ -3.61
DNF2Q12675 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-7.5□□□□□ -3.61
DNF2Q12675 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-7.65□□□□□ -3.63
DNF2Q12675 snR61snR61 90 nt-7.73□□□□□ -3.65
DNF2Q12675 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-7.78□□□□□ -3.66
DNF2Q12675 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-7.98□□□□□ -3.69
DNF2Q12675 snR53snR53 91 nt-8.01□□□□□ -3.69
DNF2Q12675 YNL338WYNL338W 159 nt-8.14□□□□□ -3.71
DNF2Q12675 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-8.29□□□□□ -3.74
DNF2Q12675 Q0032Q0032 291 nt-8.42□□□□□ -3.76
DNF2Q12675 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-8.43□□□□□ -3.76
DNF2Q12675 YMR326CYMR326C 309 nt-8.46□□□□□ -3.76
DNF2Q12675 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-8.8□□□□□ -3.82
DNF2Q12675 YHR217CYHR217C 462 nt-9.49□□□□□ -3.93
DNF2Q12675 Q0144Q0144 330 nt-9.85□□□□□ -3.99
DNF2Q12675 snR75snR75 89 nt-9.93□□□□□ -4
DNF2Q12675 ATP8Q0080 147 nt-10.57□□□□□ -4.1
DNF2Q12675 YBL109WYBL109W 336 nt-10.74□□□□□ -4.13
DNF2Q12675 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-10.76□□□□□ -4.13
DNF2Q12675 Q0092Q0092 141 nt-11.99□□□□□ -4.33
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.7 ms