Protein–RNA interactions for Protein: Q12513

TMA17, Translation machinery-associated protein 17, yeastyeast

Predictions only

Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA17Q12513 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.41□□□□□ -2.64
TMA17Q12513 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-1.41□□□□□ -2.64
TMA17Q12513 snR77snR77 88 nt-1.43□□□□□ -2.64
TMA17Q12513 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-1.48□□□□□ -2.65
TMA17Q12513 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.48□□□□□ -2.65
TMA17Q12513 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.55□□□□□ -2.66
TMA17Q12513 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-1.59□□□□□ -2.66
TMA17Q12513 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.63□□□□□ -2.67
TMA17Q12513 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.64□□□□□ -2.67
TMA17Q12513 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.65□□□□□ -2.67
TMA17Q12513 snR53snR53 91 nt-1.72□□□□□ -2.68
TMA17Q12513 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.96□□□□□ -2.72
TMA17Q12513 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.98□□□□□ -2.73
TMA17Q12513 snR6snR6 112 nt-2.01□□□□□ -2.73
TMA17Q12513 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2.11□□□□□ -2.75
TMA17Q12513 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-2.13□□□□□ -2.75
TMA17Q12513 YOR309CYOR309C 381 nt-2.16□□□□□ -2.76
TMA17Q12513 snR73snR73 106 nt-2.26□□□□□ -2.77
TMA17Q12513 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.37□□□□□ -2.79
TMA17Q12513 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-2.5□□□□□ -2.81
TMA17Q12513 snR40snR40 97 nt-2.8□□□□□ -2.86
TMA17Q12513 YDR543CYDR543C 300 nt-2.81□□□□□ -2.86
TMA17Q12513 snR58snR58 96 nt-2.89□□□□□ -2.87
TMA17Q12513 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-3.09□□□□□ -2.9
TMA17Q12513 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-3.22□□□□□ -2.92
TMA17Q12513 snR87snR87 109 nt-3.28□□□□□ -2.93
TMA17Q12513 snR75snR75 89 nt-3.29□□□□□ -2.94
TMA17Q12513 YJR162CYJR162C 351 nt-4.02□□□□□ -3.05
TMA17Q12513 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-5.32□□□□□ -3.26
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 5.6 ms