Protein–RNA interactions for Protein: Q12502

LDB19, Protein LDB19, yeastyeast

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB19Q12502 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.84□□□□□ -2.27
LDB19Q12502 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.84□□□□□ -2.27
LDB19Q12502 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.84□□□□□ -2.27
LDB19Q12502 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.84□□□□□ -2.27
LDB19Q12502 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.84□□□□□ -2.27
LDB19Q12502 snR128snR128 126 nt0.77□□□□□ -2.29
LDB19Q12502 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.75□□□□□ -2.29
LDB19Q12502 UTP10YJL109C 5310 nt0.72□□□□□ -2.29
LDB19Q12502 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.71□□□□□ -2.3
LDB19Q12502 URB1YKL014C 5295 nt0.61□□□□□ -2.31
LDB19Q12502 snR87snR87 109 nt0.51□□□□□ -2.33
LDB19Q12502 CDC65tQ(CUG)M 72 nt0.5□□□□□ -2.33
LDB19Q12502 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt0.45□□□□□ -2.34
LDB19Q12502 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.44□□□□□ -2.34
LDB19Q12502 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt0.3□□□□□ -2.36
LDB19Q12502 YOR309CYOR309C 381 nt0.21□□□□□ -2.38
LDB19Q12502 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.15□□□□□ -2.43
LDB19Q12502 snR33snR33 183 nt-0.34□□□□□ -2.46
LDB19Q12502 YNR077CYNR077C 255 nt-0.51□□□□□ -2.49
LDB19Q12502 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.57□□□□□ -2.5
LDB19Q12502 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.57□□□□□ -2.5
LDB19Q12502 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.57□□□□□ -2.5
LDB19Q12502 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.65□□□□□ -2.51
LDB19Q12502 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.82□□□□□ -2.54
LDB19Q12502 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-1.31□□□□□ -2.62
LDB19Q12502 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.46□□□□□ -2.64
LDB19Q12502 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.62□□□□□ -2.67
LDB19Q12502 YDR543CYDR543C 300 nt-1.85□□□□□ -2.71
LDB19Q12502 YJR162CYJR162C 351 nt-2.73□□□□□ -2.85
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 6.2 ms