Protein–RNA interactions for Protein: Q12500

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9, yeastyeast

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVL9Q12500 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.11□□□□□ -2.59
AVL9Q12500 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.15□□□□□ -2.59
AVL9Q12500 snR64snR64 101 nt-1.16□□□□□ -2.6
AVL9Q12500 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.2□□□□□ -2.6
AVL9Q12500 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-1.22□□□□□ -2.6
AVL9Q12500 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-1.22□□□□□ -2.6
AVL9Q12500 YBL109WYBL109W 336 nt-1.22□□□□□ -2.6
AVL9Q12500 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.23□□□□□ -2.61
AVL9Q12500 YOR309CYOR309C 381 nt-1.28□□□□□ -2.61
AVL9Q12500 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.3□□□□□ -2.62
AVL9Q12500 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-1.35□□□□□ -2.63
AVL9Q12500 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.42□□□□□ -2.64
AVL9Q12500 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-1.42□□□□□ -2.64
AVL9Q12500 snR6snR6 112 nt-1.45□□□□□ -2.64
AVL9Q12500 snR53snR53 91 nt-1.48□□□□□ -2.65
AVL9Q12500 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.49□□□□□ -2.65
AVL9Q12500 snR73snR73 106 nt-1.59□□□□□ -2.66
AVL9Q12500 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-1.7□□□□□ -2.68
AVL9Q12500 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.7□□□□□ -2.68
AVL9Q12500 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1.81□□□□□ -2.7
AVL9Q12500 snR40snR40 97 nt-2.04□□□□□ -2.74
AVL9Q12500 snR87snR87 109 nt-2.11□□□□□ -2.75
AVL9Q12500 snR58snR58 96 nt-2.12□□□□□ -2.75
AVL9Q12500 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-2.36□□□□□ -2.79
AVL9Q12500 YDR543CYDR543C 300 nt-2.38□□□□□ -2.79
AVL9Q12500 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.46□□□□□ -2.8
AVL9Q12500 snR75snR75 89 nt-2.51□□□□□ -2.81
AVL9Q12500 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.1□□□□□ -2.91
AVL9Q12500 YJR162CYJR162C 351 nt-3.15□□□□□ -2.91
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.1 ms