Protein–RNA interactions for Protein: Q12445

POM34, Nucleoporin POM34, yeastyeast

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
POM34Q12445 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-0.49□□□□□ -2.49
POM34Q12445 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.55□□□□□ -2.5
POM34Q12445 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.55□□□□□ -2.5
POM34Q12445 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.55□□□□□ -2.5
POM34Q12445 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.56□□□□□ -2.5
POM34Q12445 snR33snR33 183 nt-0.64□□□□□ -2.51
POM34Q12445 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.64□□□□□ -2.51
POM34Q12445 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-0.73□□□□□ -2.53
POM34Q12445 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.79□□□□□ -2.54
POM34Q12445 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.85□□□□□ -2.55
POM34Q12445 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.93□□□□□ -2.56
POM34Q12445 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.94□□□□□ -2.56
POM34Q12445 snR6snR6 112 nt-0.99□□□□□ -2.57
POM34Q12445 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.03□□□□□ -2.57
POM34Q12445 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.05□□□□□ -2.58
POM34Q12445 YNR077CYNR077C 255 nt-1.08□□□□□ -2.58
POM34Q12445 snR75snR75 89 nt-1.14□□□□□ -2.59
POM34Q12445 snR40snR40 97 nt-1.19□□□□□ -2.6
POM34Q12445 snR73snR73 106 nt-1.2□□□□□ -2.6
POM34Q12445 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.23□□□□□ -2.61
POM34Q12445 YOR309CYOR309C 381 nt-1.29□□□□□ -2.62
POM34Q12445 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.58□□□□□ -2.66
POM34Q12445 snR58snR58 96 nt-1.67□□□□□ -2.68
POM34Q12445 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.77□□□□□ -2.69
POM34Q12445 YDR543CYDR543C 300 nt-1.92□□□□□ -2.72
POM34Q12445 snR87snR87 109 nt-1.97□□□□□ -2.72
POM34Q12445 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.22□□□□□ -2.76
POM34Q12445 YJR162CYJR162C 351 nt-2.71□□□□□ -2.84
POM34Q12445 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.47□□□□□ -2.96
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