Protein–RNA interactions for Protein: Q12420

SNU66, 66 kDa U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein component, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNU66Q12420 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.19□□□□□ -2.6
SNU66Q12420 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.21□□□□□ -2.6
SNU66Q12420 snR64snR64 101 nt-1.24□□□□□ -2.61
SNU66Q12420 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.24□□□□□ -2.61
SNU66Q12420 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-1.26□□□□□ -2.61
SNU66Q12420 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.3□□□□□ -2.62
SNU66Q12420 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-1.31□□□□□ -2.62
SNU66Q12420 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.33□□□□□ -2.62
SNU66Q12420 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-1.4□□□□□ -2.63
SNU66Q12420 snR6snR6 112 nt-1.49□□□□□ -2.65
SNU66Q12420 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.49□□□□□ -2.65
SNU66Q12420 YOR309CYOR309C 381 nt-1.52□□□□□ -2.65
SNU66Q12420 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.54□□□□□ -2.66
SNU66Q12420 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-1.57□□□□□ -2.66
SNU66Q12420 snR53snR53 91 nt-1.59□□□□□ -2.66
SNU66Q12420 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.65□□□□□ -2.67
SNU66Q12420 snR73snR73 106 nt-1.67□□□□□ -2.68
SNU66Q12420 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-1.77□□□□□ -2.69
SNU66Q12420 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1.97□□□□□ -2.72
SNU66Q12420 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.13□□□□□ -2.75
SNU66Q12420 snR40snR40 97 nt-2.2□□□□□ -2.76
SNU66Q12420 snR58snR58 96 nt-2.41□□□□□ -2.8
SNU66Q12420 snR87snR87 109 nt-2.42□□□□□ -2.8
SNU66Q12420 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-2.64□□□□□ -2.83
SNU66Q12420 snR75snR75 89 nt-2.75□□□□□ -2.85
SNU66Q12420 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.76□□□□□ -2.85
SNU66Q12420 YDR543CYDR543C 300 nt-2.85□□□□□ -2.87
SNU66Q12420 YJR162CYJR162C 351 nt-3.85□□□□□ -3.03
SNU66Q12420 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.93□□□□□ -3.04
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 6.8 ms