Protein–RNA interactions for Protein: Q12317

MSB4, GTPase-activating protein MSB4, yeastyeast

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSB4Q12317 YJL113WYJL113W 4647 nt0.89□□□□□ -2.27
MSB4Q12317 snR58snR58 96 nt0.88□□□□□ -2.27
MSB4Q12317 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.84□□□□□ -2.27
MSB4Q12317 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.8□□□□□ -2.28
MSB4Q12317 snR73snR73 106 nt0.77□□□□□ -2.29
MSB4Q12317 snR161snR161 161 nt0.76□□□□□ -2.29
MSB4Q12317 UTP10YJL109C 5310 nt0.75□□□□□ -2.29
MSB4Q12317 snR128snR128 126 nt0.75□□□□□ -2.29
MSB4Q12317 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.67□□□□□ -2.3
MSB4Q12317 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.44□□□□□ -2.34
MSB4Q12317 URB1YKL014C 5295 nt0.35□□□□□ -2.35
MSB4Q12317 CDC65tQ(CUG)M 72 nt0.34□□□□□ -2.36
MSB4Q12317 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt0.3□□□□□ -2.36
MSB4Q12317 snR87snR87 109 nt0.18□□□□□ -2.38
MSB4Q12317 YOR309CYOR309C 381 nt0.04□□□□□ -2.4
MSB4Q12317 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.08□□□□□ -2.42
MSB4Q12317 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.24□□□□□ -2.45
MSB4Q12317 snR33snR33 183 nt-0.43□□□□□ -2.48
MSB4Q12317 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.73□□□□□ -2.53
MSB4Q12317 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.73□□□□□ -2.53
MSB4Q12317 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.73□□□□□ -2.53
MSB4Q12317 YNR077CYNR077C 255 nt-0.81□□□□□ -2.54
MSB4Q12317 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.85□□□□□ -2.55
MSB4Q12317 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.97□□□□□ -2.56
MSB4Q12317 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-1.78□□□□□ -2.69
MSB4Q12317 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.88□□□□□ -2.71
MSB4Q12317 YDR543CYDR543C 300 nt-2.24□□□□□ -2.77
MSB4Q12317 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.41□□□□□ -2.8
MSB4Q12317 YJR162CYJR162C 351 nt-3.19□□□□□ -2.92
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 5.4 ms