Protein–RNA interactions for Protein: Q12272

TPT1, tRNA 2'-phosphotransferase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TPT1Q12272 snR85snR85 171 nt-1.33□□□□□ -2.62
TPT1Q12272 snR64snR64 101 nt-1.39□□□□□ -2.63
TPT1Q12272 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.41□□□□□ -2.64
TPT1Q12272 YBL109WYBL109W 336 nt-1.41□□□□□ -2.64
TPT1Q12272 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.43□□□□□ -2.64
TPT1Q12272 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-1.46□□□□□ -2.64
TPT1Q12272 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.46□□□□□ -2.64
TPT1Q12272 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-1.47□□□□□ -2.64
TPT1Q12272 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.55□□□□□ -2.66
TPT1Q12272 snR6snR6 112 nt-1.61□□□□□ -2.67
TPT1Q12272 YOR309CYOR309C 381 nt-1.64□□□□□ -2.67
TPT1Q12272 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-1.65□□□□□ -2.67
TPT1Q12272 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.67□□□□□ -2.68
TPT1Q12272 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.74□□□□□ -2.69
TPT1Q12272 snR53snR53 91 nt-1.75□□□□□ -2.69
TPT1Q12272 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-1.76□□□□□ -2.69
TPT1Q12272 snR73snR73 106 nt-1.8□□□□□ -2.7
TPT1Q12272 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-1.96□□□□□ -2.72
TPT1Q12272 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.07□□□□□ -2.74
TPT1Q12272 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-2.12□□□□□ -2.75
TPT1Q12272 snR40snR40 97 nt-2.4□□□□□ -2.79
TPT1Q12272 YDR543CYDR543C 300 nt-2.49□□□□□ -2.81
TPT1Q12272 snR58snR58 96 nt-2.53□□□□□ -2.81
TPT1Q12272 snR87snR87 109 nt-2.58□□□□□ -2.82
TPT1Q12272 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-2.78□□□□□ -2.85
TPT1Q12272 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.79□□□□□ -2.86
TPT1Q12272 snR75snR75 89 nt-2.99□□□□□ -2.89
TPT1Q12272 YJR162CYJR162C 351 nt-3.52□□□□□ -2.97
TPT1Q12272 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-4.15□□□□□ -3.07
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 5.7 ms