Protein–RNA interactions for Protein: Q12271

INP53, Polyphosphatidylinositol phosphatase INP53, yeastyeast

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Length 1,107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
INP53Q12271 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-0.64□□□□□ -2.51
INP53Q12271 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
INP53Q12271 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
INP53Q12271 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
INP53Q12271 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.66□□□□□ -2.52
INP53Q12271 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-0.66□□□□□ -2.52
INP53Q12271 snR53snR53 91 nt-0.66□□□□□ -2.52
INP53Q12271 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.69□□□□□ -2.52
INP53Q12271 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.77□□□□□ -2.53
INP53Q12271 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-0.81□□□□□ -2.54
INP53Q12271 snR6snR6 112 nt-0.89□□□□□ -2.55
INP53Q12271 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.9□□□□□ -2.55
INP53Q12271 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.92□□□□□ -2.56
INP53Q12271 YOR309CYOR309C 381 nt-0.99□□□□□ -2.57
INP53Q12271 YNR077CYNR077C 255 nt-1.01□□□□□ -2.57
INP53Q12271 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.02□□□□□ -2.57
INP53Q12271 snR73snR73 106 nt-1.03□□□□□ -2.57
INP53Q12271 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.09□□□□□ -2.58
INP53Q12271 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1.13□□□□□ -2.59
INP53Q12271 snR40snR40 97 nt-1.22□□□□□ -2.6
INP53Q12271 snR75snR75 89 nt-1.44□□□□□ -2.64
INP53Q12271 snR58snR58 96 nt-1.57□□□□□ -2.66
INP53Q12271 snR87snR87 109 nt-1.6□□□□□ -2.67
INP53Q12271 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.68□□□□□ -2.68
INP53Q12271 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.76□□□□□ -2.69
INP53Q12271 YDR543CYDR543C 300 nt-2.05□□□□□ -2.74
INP53Q12271 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.18□□□□□ -2.76
INP53Q12271 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.8□□□□□ -2.86
INP53Q12271 YJR162CYJR162C 351 nt-2.96□□□□□ -2.88
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 2.9 ms