Protein–RNA interactions for Protein: Q12260

TY2A-B, Transposon Ty2-B Gag polyprotein, yeast

Predictions only

Length 438 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TY2A-B	Q12260	YBL109W	YBL109W	336 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
TY2A-B	Q12260	snR64	snR64	101 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
TY2A-B	Q12260	YDL114W-A	YDL114W-A	114 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
TY2A-B	Q12260	tV(UAC)Q	tV(UAC)Q	76 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
TY2A-B	Q12260	YGR122C-A	YGR122C-A	129 nt		-0.84	□□□□□ -2.54
TY2A-B	Q12260	tY(GUA)Q	tY(GUA)Q	84 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
TY2A-B	Q12260	YOR309C	YOR309C	381 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
TY2A-B	Q12260	YLL066W-B	YLL066W-B	171 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
TY2A-B	Q12260	snR6	snR6	112 nt		-0.88	□□□□□ -2.55
TY2A-B	Q12260	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
TY2A-B	Q12260	YOR335W-A	YOR335W-A	81 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
TY2A-B	Q12260	YNR077C	YNR077C	255 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
TY2A-B	Q12260	snR73	snR73	106 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
TY2A-B	Q12260	RPL41B	YDL133C-A	78 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
TY2A-B	Q12260	YDR524C-A	YDR524C-A	120 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
TY2A-B	Q12260	snR53	snR53	91 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
TY2A-B	Q12260	YDL247W-A	YDL247W-A	75 nt		-1.12	□□□□□ -2.59
TY2A-B	Q12260	YLR149C-A	YLR149C-A	87 nt		-1.13	□□□□□ -2.59
TY2A-B	Q12260	YKL096C-B	YKL096C-B	150 nt		-1.2	□□□□□ -2.6
TY2A-B	Q12260	snR40	snR40	97 nt		-1.35	□□□□□ -2.63
TY2A-B	Q12260	YBR126W-B	YBR126W-B	144 nt		-1.36	□□□□□ -2.63
TY2A-B	Q12260	snR87	snR87	109 nt		-1.4	□□□□□ -2.63
TY2A-B	Q12260	snR58	snR58	96 nt		-1.49	□□□□□ -2.65
TY2A-B	Q12260	tC(GCA)Q	tC(GCA)Q	76 nt		-1.61	□□□□□ -2.67
TY2A-B	Q12260	snR75	snR75	89 nt		-1.73	□□□□□ -2.69
TY2A-B	Q12260	YDR543C	YDR543C	300 nt		-2.03	□□□□□ -2.73
TY2A-B	Q12260	YOL166W-A	YOL166W-A	156 nt		-2.26	□□□□□ -2.77
TY2A-B	Q12260	YJL136W-A	YJL136W-A	84 nt		-2.27	□□□□□ -2.77
TY2A-B	Q12260	YJR162C	YJR162C	351 nt		-2.59	□□□□□ -2.82

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