Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-0.9□□□□□ -2.55
LSP1Q12230 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-0.92□□□□□ -2.56
LSP1Q12230 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.96□□□□□ -2.56
LSP1Q12230 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.97□□□□□ -2.56
LSP1Q12230 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-0.99□□□□□ -2.57
LSP1Q12230 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.03□□□□□ -2.57
LSP1Q12230 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.05□□□□□ -2.58
LSP1Q12230 snR53snR53 91 nt-1.1□□□□□ -2.59
LSP1Q12230 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.12□□□□□ -2.59
LSP1Q12230 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.24□□□□□ -2.61
LSP1Q12230 snR6snR6 112 nt-1.31□□□□□ -2.62
LSP1Q12230 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-1.34□□□□□ -2.62
LSP1Q12230 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.38□□□□□ -2.63
LSP1Q12230 YOR309CYOR309C 381 nt-1.44□□□□□ -2.64
LSP1Q12230 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.45□□□□□ -2.64
LSP1Q12230 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.47□□□□□ -2.64
LSP1Q12230 snR73snR73 106 nt-1.51□□□□□ -2.65
LSP1Q12230 YNR077CYNR077C 255 nt-1.67□□□□□ -2.68
LSP1Q12230 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1.71□□□□□ -2.68
LSP1Q12230 snR40snR40 97 nt-1.88□□□□□ -2.71
LSP1Q12230 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.1□□□□□ -2.75
LSP1Q12230 snR58snR58 96 nt-2.14□□□□□ -2.75
LSP1Q12230 snR75snR75 89 nt-2.24□□□□□ -2.77
LSP1Q12230 snR87snR87 109 nt-2.26□□□□□ -2.77
LSP1Q12230 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-2.34□□□□□ -2.78
LSP1Q12230 YDR543CYDR543C 300 nt-2.86□□□□□ -2.87
LSP1Q12230 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-3.56□□□□□ -2.98
LSP1Q12230 YJR162CYJR162C 351 nt-3.82□□□□□ -3.02
LSP1Q12230 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.84□□□□□ -3.02
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 5.2 ms