Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

Predictions only

Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 snR61snR61 90 nt-1.77□□□□□ -2.69
NFI1Q12216 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-1.79□□□□□ -2.7
NFI1Q12216 snR62snR62 100 nt-1.81□□□□□ -2.7
NFI1Q12216 YNL170WYNL170W 396 nt-1.81□□□□□ -2.7
NFI1Q12216 Q0032Q0032 291 nt-1.83□□□□□ -2.7
NFI1Q12216 snR64snR64 101 nt-1.85□□□□□ -2.71
NFI1Q12216 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-1.85□□□□□ -2.71
NFI1Q12216 YDR543CYDR543C 300 nt-1.87□□□□□ -2.71
NFI1Q12216 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1.92□□□□□ -2.72
NFI1Q12216 snR87snR87 109 nt-1.99□□□□□ -2.73
NFI1Q12216 YLR294CYLR294C 330 nt-2□□□□□ -2.73
NFI1Q12216 YOR225WYOR225W 330 nt-2.1□□□□□ -2.75
NFI1Q12216 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.13□□□□□ -2.75
NFI1Q12216 snR58snR58 96 nt-2.16□□□□□ -2.76
NFI1Q12216 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-2.16□□□□□ -2.76
NFI1Q12216 ATP8Q0080 147 nt-2.22□□□□□ -2.76
NFI1Q12216 YMR326CYMR326C 309 nt-2.26□□□□□ -2.77
NFI1Q12216 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-2.28□□□□□ -2.77
NFI1Q12216 snR53snR53 91 nt-2.28□□□□□ -2.77
NFI1Q12216 snR40snR40 97 nt-2.29□□□□□ -2.78
NFI1Q12216 Q0143Q0143 153 nt-2.3□□□□□ -2.78
NFI1Q12216 YHR217CYHR217C 462 nt-2.3□□□□□ -2.78
NFI1Q12216 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-2.43□□□□□ -2.8
NFI1Q12216 YBL109WYBL109W 336 nt-2.47□□□□□ -2.8
NFI1Q12216 Q0092Q0092 141 nt-2.54□□□□□ -2.82
NFI1Q12216 YJR162CYJR162C 351 nt-2.69□□□□□ -2.84
NFI1Q12216 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-2.7□□□□□ -2.84
NFI1Q12216 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.74□□□□□ -2.85
NFI1Q12216 snR75snR75 89 nt-3.1□□□□□ -2.91
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 5.2 ms