Protein–RNA interactions for Protein: Q12127

CCW12, Covalently-linked cell wall protein 12, yeastyeast

Predictions only

Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCW12Q12127 snR61snR61 90 nt-2.14□□□□□ -2.75
CCW12Q12127 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-2.15□□□□□ -2.75
CCW12Q12127 snR62snR62 100 nt-2.18□□□□□ -2.76
CCW12Q12127 Q0032Q0032 291 nt-2.22□□□□□ -2.76
CCW12Q12127 YNL170WYNL170W 396 nt-2.22□□□□□ -2.76
CCW12Q12127 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-2.23□□□□□ -2.77
CCW12Q12127 snR64snR64 101 nt-2.26□□□□□ -2.77
CCW12Q12127 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-2.34□□□□□ -2.78
CCW12Q12127 YDR543CYDR543C 300 nt-2.4□□□□□ -2.79
CCW12Q12127 snR87snR87 109 nt-2.43□□□□□ -2.8
CCW12Q12127 YLR294CYLR294C 330 nt-2.44□□□□□ -2.8
CCW12Q12127 YOR225WYOR225W 330 nt-2.54□□□□□ -2.82
CCW12Q12127 snR58snR58 96 nt-2.58□□□□□ -2.82
CCW12Q12127 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-2.67□□□□□ -2.84
CCW12Q12127 ATP8Q0080 147 nt-2.7□□□□□ -2.84
CCW12Q12127 snR53snR53 91 nt-2.72□□□□□ -2.84
CCW12Q12127 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-2.74□□□□□ -2.85
CCW12Q12127 YMR326CYMR326C 309 nt-2.74□□□□□ -2.85
CCW12Q12127 YHR217CYHR217C 462 nt-2.76□□□□□ -2.85
CCW12Q12127 Q0143Q0143 153 nt-2.8□□□□□ -2.86
CCW12Q12127 snR40snR40 97 nt-2.8□□□□□ -2.86
CCW12Q12127 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.87□□□□□ -2.87
CCW12Q12127 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-2.9□□□□□ -2.87
CCW12Q12127 YBL109WYBL109W 336 nt-3.04□□□□□ -2.9
CCW12Q12127 Q0092Q0092 141 nt-3.11□□□□□ -2.91
CCW12Q12127 YJR162CYJR162C 351 nt-3.26□□□□□ -2.93
CCW12Q12127 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-3.27□□□□□ -2.93
CCW12Q12127 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.36□□□□□ -2.95
CCW12Q12127 snR75snR75 89 nt-3.78□□□□□ -3.01
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.8 ms