Protein–RNA interactions for Protein: Q12100

RTK1, Probable serine/threonine-protein kinase RTK1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTK1Q12100 YNR077CYNR077C 255 nt-0.7□□□□□ -2.52
RTK1Q12100 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-0.77□□□□□ -2.53
RTK1Q12100 snR77snR77 88 nt-0.8□□□□□ -2.54
RTK1Q12100 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.8□□□□□ -2.54
RTK1Q12100 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-0.86□□□□□ -2.55
RTK1Q12100 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.87□□□□□ -2.55
RTK1Q12100 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.88□□□□□ -2.55
RTK1Q12100 snR53snR53 91 nt-0.9□□□□□ -2.55
RTK1Q12100 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-0.91□□□□□ -2.56
RTK1Q12100 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-0.92□□□□□ -2.56
RTK1Q12100 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.01□□□□□ -2.57
RTK1Q12100 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.11□□□□□ -2.59
RTK1Q12100 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-1.16□□□□□ -2.6
RTK1Q12100 snR6snR6 112 nt-1.2□□□□□ -2.6
RTK1Q12100 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.24□□□□□ -2.61
RTK1Q12100 YOR309CYOR309C 381 nt-1.25□□□□□ -2.61
RTK1Q12100 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.33□□□□□ -2.62
RTK1Q12100 snR73snR73 106 nt-1.36□□□□□ -2.63
RTK1Q12100 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1.52□□□□□ -2.65
RTK1Q12100 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.53□□□□□ -2.65
RTK1Q12100 snR40snR40 97 nt-1.71□□□□□ -2.68
RTK1Q12100 snR58snR58 96 nt-1.98□□□□□ -2.73
RTK1Q12100 snR75snR75 89 nt-2.01□□□□□ -2.73
RTK1Q12100 snR87snR87 109 nt-2.01□□□□□ -2.73
RTK1Q12100 YDR543CYDR543C 300 nt-2.03□□□□□ -2.73
RTK1Q12100 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.08□□□□□ -2.74
RTK1Q12100 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-2.15□□□□□ -2.75
RTK1Q12100 YJR162CYJR162C 351 nt-2.78□□□□□ -2.85
RTK1Q12100 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.09□□□□□ -2.9
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.6 ms