Protein–RNA interactions for Protein: Q12089

AEP3, ATPase expression protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AEP3Q12089 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.27□□□□□ -2.61
AEP3Q12089 YOR309CYOR309C 381 nt-1.27□□□□□ -2.61
AEP3Q12089 snR6snR6 112 nt-1.29□□□□□ -2.62
AEP3Q12089 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.3□□□□□ -2.62
AEP3Q12089 snR64snR64 101 nt-1.34□□□□□ -2.62
AEP3Q12089 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-1.35□□□□□ -2.63
AEP3Q12089 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.36□□□□□ -2.63
AEP3Q12089 YMR326CYMR326C 309 nt-1.41□□□□□ -2.64
AEP3Q12089 YHR217CYHR217C 462 nt-1.42□□□□□ -2.64
AEP3Q12089 snR73snR73 106 nt-1.45□□□□□ -2.64
AEP3Q12089 snR85snR85 171 nt-1.48□□□□□ -2.65
AEP3Q12089 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-1.48□□□□□ -2.65
AEP3Q12089 YBL109WYBL109W 336 nt-1.5□□□□□ -2.65
AEP3Q12089 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.51□□□□□ -2.65
AEP3Q12089 snR53snR53 91 nt-1.66□□□□□ -2.68
AEP3Q12089 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-1.76□□□□□ -2.69
AEP3Q12089 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-1.77□□□□□ -2.69
AEP3Q12089 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1.78□□□□□ -2.69
AEP3Q12089 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.85□□□□□ -2.71
AEP3Q12089 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-1.86□□□□□ -2.71
AEP3Q12089 snR87snR87 109 nt-2.04□□□□□ -2.74
AEP3Q12089 snR40snR40 97 nt-2.05□□□□□ -2.74
AEP3Q12089 snR58snR58 96 nt-2.13□□□□□ -2.75
AEP3Q12089 YDR543CYDR543C 300 nt-2.24□□□□□ -2.77
AEP3Q12089 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-2.34□□□□□ -2.78
AEP3Q12089 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.59□□□□□ -2.82
AEP3Q12089 snR75snR75 89 nt-2.66□□□□□ -2.84
AEP3Q12089 YJR162CYJR162C 351 nt-3.18□□□□□ -2.92
AEP3Q12089 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.21□□□□□ -2.92
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 4.8 ms