Protein–RNA interactions for Protein: Q12049

THP3, Protein THP3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
THP3Q12049 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-0.81□□□□□ -2.54
THP3Q12049 snR77snR77 88 nt-0.84□□□□□ -2.54
THP3Q12049 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-0.84□□□□□ -2.54
THP3Q12049 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-0.88□□□□□ -2.55
THP3Q12049 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.9□□□□□ -2.55
THP3Q12049 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.92□□□□□ -2.56
THP3Q12049 snR53snR53 91 nt-0.93□□□□□ -2.56
THP3Q12049 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-0.94□□□□□ -2.56
THP3Q12049 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.02□□□□□ -2.57
THP3Q12049 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.06□□□□□ -2.58
THP3Q12049 YNR077CYNR077C 255 nt-1.15□□□□□ -2.59
THP3Q12049 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-1.18□□□□□ -2.6
THP3Q12049 snR6snR6 112 nt-1.23□□□□□ -2.61
THP3Q12049 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.26□□□□□ -2.61
THP3Q12049 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.28□□□□□ -2.61
THP3Q12049 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.33□□□□□ -2.62
THP3Q12049 YOR309CYOR309C 381 nt-1.35□□□□□ -2.63
THP3Q12049 snR73snR73 106 nt-1.4□□□□□ -2.63
THP3Q12049 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1.47□□□□□ -2.64
THP3Q12049 snR40snR40 97 nt-1.67□□□□□ -2.68
THP3Q12049 snR58snR58 96 nt-1.89□□□□□ -2.71
THP3Q12049 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.92□□□□□ -2.72
THP3Q12049 snR75snR75 89 nt-1.94□□□□□ -2.72
THP3Q12049 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-2.07□□□□□ -2.74
THP3Q12049 snR87snR87 109 nt-2.09□□□□□ -2.74
THP3Q12049 YDR543CYDR543C 300 nt-2.41□□□□□ -2.8
THP3Q12049 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.79□□□□□ -2.86
THP3Q12049 YJR162CYJR162C 351 nt-3.38□□□□□ -2.95
THP3Q12049 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.51□□□□□ -2.97
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 5.3 ms