Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	snR73	snR73	106 nt		-1.77	□□□□□ -2.69
VIK1	Q12045	snR62	snR62	100 nt		-1.8	□□□□□ -2.7
VIK1	Q12045	RPL41B	YDL133C-A	78 nt		-1.81	□□□□□ -2.7
VIK1	Q12045	YDL159W-A	YDL159W-A	132 nt		-1.81	□□□□□ -2.7
VIK1	Q12045	YBR126W-B	YBR126W-B	144 nt		-1.81	□□□□□ -2.7
VIK1	Q12045	ATP8	Q0080	147 nt		-1.86	□□□□□ -2.71
VIK1	Q12045	YGR122C-A	YGR122C-A	129 nt		-1.86	□□□□□ -2.71
VIK1	Q12045	snR85	snR85	171 nt		-1.87	□□□□□ -2.71
VIK1	Q12045	snR64	snR64	101 nt		-1.93	□□□□□ -2.72
VIK1	Q12045	Q0143	Q0143	153 nt		-2.11	□□□□□ -2.75
VIK1	Q12045	Q0092	Q0092	141 nt		-2.21	□□□□□ -2.76
VIK1	Q12045	YKL096C-B	YKL096C-B	150 nt		-2.23	□□□□□ -2.77
VIK1	Q12045	YMR326C	YMR326C	309 nt		-2.23	□□□□□ -2.77
VIK1	Q12045	YLL066W-B	YLL066W-B	171 nt		-2.24	□□□□□ -2.77
VIK1	Q12045	YDR543C	YDR543C	300 nt		-2.25	□□□□□ -2.77
VIK1	Q12045	YHR217C	YHR217C	462 nt		-2.25	□□□□□ -2.77
VIK1	Q12045	YDR524C-A	YDR524C-A	120 nt		-2.3	□□□□□ -2.78
VIK1	Q12045	snR53	snR53	91 nt		-2.35	□□□□□ -2.79
VIK1	Q12045	YOL166W-A	YOL166W-A	156 nt		-2.38	□□□□□ -2.79
VIK1	Q12045	snR87	snR87	109 nt		-2.39	□□□□□ -2.79
VIK1	Q12045	YLR149C-A	YLR149C-A	87 nt		-2.42	□□□□□ -2.8
VIK1	Q12045	YBL109W	YBL109W	336 nt		-2.43	□□□□□ -2.8
VIK1	Q12045	snR58	snR58	96 nt		-2.54	□□□□□ -2.82
VIK1	Q12045	snR40	snR40	97 nt		-2.61	□□□□□ -2.83
VIK1	Q12045	YDL247W-A	YDL247W-A	75 nt		-2.75	□□□□□ -2.85
VIK1	Q12045	tC(GCA)Q	tC(GCA)Q	76 nt		-2.81	□□□□□ -2.86
VIK1	Q12045	YJR162C	YJR162C	351 nt		-3.21	□□□□□ -2.92
VIK1	Q12045	snR75	snR75	89 nt		-3.46	□□□□□ -2.96
VIK1	Q12045	YJL136W-A	YJL136W-A	84 nt		-3.54	□□□□□ -2.98

Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.5 ms