Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VIK1Q12045 snR73snR73 106 nt-1.77□□□□□ -2.69
VIK1Q12045 snR62snR62 100 nt-1.8□□□□□ -2.7
VIK1Q12045 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.81□□□□□ -2.7
VIK1Q12045 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.81□□□□□ -2.7
VIK1Q12045 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.81□□□□□ -2.7
VIK1Q12045 ATP8Q0080 147 nt-1.86□□□□□ -2.71
VIK1Q12045 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-1.86□□□□□ -2.71
VIK1Q12045 snR85snR85 171 nt-1.87□□□□□ -2.71
VIK1Q12045 snR64snR64 101 nt-1.93□□□□□ -2.72
VIK1Q12045 Q0143Q0143 153 nt-2.11□□□□□ -2.75
VIK1Q12045 Q0092Q0092 141 nt-2.21□□□□□ -2.76
VIK1Q12045 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-2.23□□□□□ -2.77
VIK1Q12045 YMR326CYMR326C 309 nt-2.23□□□□□ -2.77
VIK1Q12045 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-2.24□□□□□ -2.77
VIK1Q12045 YDR543CYDR543C 300 nt-2.25□□□□□ -2.77
VIK1Q12045 YHR217CYHR217C 462 nt-2.25□□□□□ -2.77
VIK1Q12045 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-2.3□□□□□ -2.78
VIK1Q12045 snR53snR53 91 nt-2.35□□□□□ -2.79
VIK1Q12045 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.38□□□□□ -2.79
VIK1Q12045 snR87snR87 109 nt-2.39□□□□□ -2.79
VIK1Q12045 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-2.42□□□□□ -2.8
VIK1Q12045 YBL109WYBL109W 336 nt-2.43□□□□□ -2.8
VIK1Q12045 snR58snR58 96 nt-2.54□□□□□ -2.82
VIK1Q12045 snR40snR40 97 nt-2.61□□□□□ -2.83
VIK1Q12045 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-2.75□□□□□ -2.85
VIK1Q12045 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-2.81□□□□□ -2.86
VIK1Q12045 YJR162CYJR162C 351 nt-3.21□□□□□ -2.92
VIK1Q12045 snR75snR75 89 nt-3.46□□□□□ -2.96
VIK1Q12045 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.54□□□□□ -2.98
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