Protein–RNA interactions for Protein: Q12009

TRM8, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM8Q12009 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.32□□□□□ -2.62
TRM8Q12009 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.34□□□□□ -2.62
TRM8Q12009 snR64snR64 101 nt-1.48□□□□□ -2.65
TRM8Q12009 YBL109WYBL109W 336 nt-1.51□□□□□ -2.65
TRM8Q12009 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.57□□□□□ -2.66
TRM8Q12009 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-1.57□□□□□ -2.66
TRM8Q12009 YOR309CYOR309C 381 nt-1.59□□□□□ -2.66
TRM8Q12009 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-1.62□□□□□ -2.67
TRM8Q12009 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-1.65□□□□□ -2.67
TRM8Q12009 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.68□□□□□ -2.68
TRM8Q12009 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.7□□□□□ -2.68
TRM8Q12009 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-1.7□□□□□ -2.68
TRM8Q12009 snR53snR53 91 nt-1.84□□□□□ -2.7
TRM8Q12009 snR6snR6 112 nt-1.85□□□□□ -2.71
TRM8Q12009 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.9□□□□□ -2.71
TRM8Q12009 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.91□□□□□ -2.72
TRM8Q12009 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.93□□□□□ -2.72
TRM8Q12009 snR73snR73 106 nt-1.98□□□□□ -2.73
TRM8Q12009 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-2.21□□□□□ -2.76
TRM8Q12009 YDR543CYDR543C 300 nt-2.43□□□□□ -2.8
TRM8Q12009 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-2.43□□□□□ -2.8
TRM8Q12009 snR87snR87 109 nt-2.58□□□□□ -2.82
TRM8Q12009 snR40snR40 97 nt-2.75□□□□□ -2.85
TRM8Q12009 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.77□□□□□ -2.85
TRM8Q12009 snR58snR58 96 nt-2.79□□□□□ -2.86
TRM8Q12009 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-3.1□□□□□ -2.91
TRM8Q12009 snR75snR75 89 nt-3.3□□□□□ -2.94
TRM8Q12009 YJR162CYJR162C 351 nt-3.42□□□□□ -2.96
TRM8Q12009 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.59□□□□□ -2.98
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.5 ms