Protein–RNA interactions for Protein: Q12006

PFA4, Palmitoyltransferase PFA4, yeastyeast

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFA4Q12006 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-0.41□□□□□ -2.48
PFA4Q12006 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-0.43□□□□□ -2.48
PFA4Q12006 snR77snR77 88 nt-0.44□□□□□ -2.48
PFA4Q12006 snR33snR33 183 nt-0.44□□□□□ -2.48
PFA4Q12006 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.48□□□□□ -2.49
PFA4Q12006 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.48□□□□□ -2.49
PFA4Q12006 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.48□□□□□ -2.49
PFA4Q12006 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.55□□□□□ -2.5
PFA4Q12006 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-0.6□□□□□ -2.51
PFA4Q12006 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.7□□□□□ -2.52
PFA4Q12006 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.73□□□□□ -2.53
PFA4Q12006 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.81□□□□□ -2.54
PFA4Q12006 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.84□□□□□ -2.54
PFA4Q12006 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.88□□□□□ -2.55
PFA4Q12006 snR6snR6 112 nt-0.89□□□□□ -2.55
PFA4Q12006 YOR309CYOR309C 381 nt-0.96□□□□□ -2.56
PFA4Q12006 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.96□□□□□ -2.56
PFA4Q12006 snR75snR75 89 nt-0.97□□□□□ -2.56
PFA4Q12006 YNR077CYNR077C 255 nt-0.97□□□□□ -2.56
PFA4Q12006 snR40snR40 97 nt-1.03□□□□□ -2.57
PFA4Q12006 snR73snR73 106 nt-1.08□□□□□ -2.58
PFA4Q12006 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.2□□□□□ -2.6
PFA4Q12006 snR58snR58 96 nt-1.4□□□□□ -2.63
PFA4Q12006 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.52□□□□□ -2.65
PFA4Q12006 snR87snR87 109 nt-1.59□□□□□ -2.66
PFA4Q12006 YDR543CYDR543C 300 nt-1.69□□□□□ -2.68
PFA4Q12006 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.06□□□□□ -2.74
PFA4Q12006 YJR162CYJR162C 351 nt-2.2□□□□□ -2.76
PFA4Q12006 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.28□□□□□ -2.77
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 249.4 ms