Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VgfQ0VGU4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VgfQ0VGU4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VgfQ0VGU4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VgfQ0VGU4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VgfQ0VGU4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
VgfQ0VGU4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VgfQ0VGU4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VgfQ0VGU4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
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VgfQ0VGU4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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VgfQ0VGU4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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VgfQ0VGU4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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VgfQ0VGU4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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VgfQ0VGU4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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VgfQ0VGU4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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VgfQ0VGU4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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VgfQ0VGU4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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VgfQ0VGU4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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VgfQ0VGU4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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VgfQ0VGU4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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VgfQ0VGU4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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VgfQ0VGU4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VgfQ0VGU4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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VgfQ0VGU4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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