Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntnap5bQ0V8T8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntnap5bQ0V8T8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms