Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms