Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn2Q08093 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms