Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NrepQ07475 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms