Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms