Protein–RNA interactions for Protein: Q05931

SSQ1, Heat shock protein SSQ1, mitochondrial, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1Q05931 YDR543CYDR543C 300 nt-2.63□□□□□ -2.83
SSQ1Q05931 snR62snR62 100 nt-2.66□□□□□ -2.84
SSQ1Q05931 snR85snR85 171 nt-2.66□□□□□ -2.84
SSQ1Q05931 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-2.72□□□□□ -2.84
SSQ1Q05931 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-2.75□□□□□ -2.85
SSQ1Q05931 YNL170WYNL170W 396 nt-2.78□□□□□ -2.85
SSQ1Q05931 snR64snR64 101 nt-2.84□□□□□ -2.86
SSQ1Q05931 YLR294CYLR294C 330 nt-2.9□□□□□ -2.87
SSQ1Q05931 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.9□□□□□ -2.87
SSQ1Q05931 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-2.93□□□□□ -2.88
SSQ1Q05931 YOR225WYOR225W 330 nt-2.94□□□□□ -2.88
SSQ1Q05931 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-3.12□□□□□ -2.91
SSQ1Q05931 ATP8Q0080 147 nt-3.21□□□□□ -2.92
SSQ1Q05931 snR87snR87 109 nt-3.28□□□□□ -2.93
SSQ1Q05931 Q0143Q0143 153 nt-3.37□□□□□ -2.95
SSQ1Q05931 YHR217CYHR217C 462 nt-3.37□□□□□ -2.95
SSQ1Q05931 snR53snR53 91 nt-3.37□□□□□ -2.95
SSQ1Q05931 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-3.39□□□□□ -2.95
SSQ1Q05931 YMR326CYMR326C 309 nt-3.39□□□□□ -2.95
SSQ1Q05931 snR58snR58 96 nt-3.43□□□□□ -2.96
SSQ1Q05931 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-3.48□□□□□ -2.97
SSQ1Q05931 snR40snR40 97 nt-3.71□□□□□ -3
SSQ1Q05931 Q0092Q0092 141 nt-3.73□□□□□ -3.01
SSQ1Q05931 YBL109WYBL109W 336 nt-3.76□□□□□ -3.01
SSQ1Q05931 YJR162CYJR162C 351 nt-3.77□□□□□ -3.01
SSQ1Q05931 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-3.85□□□□□ -3.03
SSQ1Q05931 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-4.1□□□□□ -3.07
SSQ1Q05931 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-4.24□□□□□ -3.09
SSQ1Q05931 snR75snR75 89 nt-4.95□□□□□ -3.2
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 23 ms