Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sox9Q04887 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox9Q04887 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms