Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms